Los estudios genéticos realizados por científicos de la Universidad Javeriana correspondientes a Chocó se llevaron a cabo en comunidades negras de Quibdó e indígenas wounaan de la provincia del San Juan.

Según el estudio existen evidencias claras que relacionan la variación del ADN mitocondrial con el origen étnico y geográfico de cada individuo con base en el análisis de los haplogrupos o linajes fundadores del ADN mitocondrial en el continente americano.

De acuerdo con los resultados de la investigación respecto al origen genético de los chocoanos se puede concluir que:

1. En la genética de los chocoanos se observa claramente la presencia de haplogrupos originarios del continente africano pero también de Europa y Asia.

2. Se evidencia la mezcla entre individuos negros e indígenas.

3. La mezcla de los negros con los colonizadores europeos dio lugar a una gran variedad de linajes de origen africano y europeo.

4. No es posible determinar hoy con precisión de cuales regiones de África provenían los hombres y mujeres llevados a la región chocoana como esclavizados debido al complejo proceso de mixtura genética que ocurrió posteriormente.

5. Las características genéticas de los chocoanos presentan rasgos predominantemente europeos.

El equipo de investigadores dice además que "a pesar del enorme trabajo en el campo de la genética (...) tendientes a reconstruir la historia del hombre americano, tenemos ante nuestros ojos un rompecabezas al cual aún le faltan muchas piezas" y que un estudio posterior " ayudará a esclarecer las modalidades del poblamiento de América y permitirá ampliar el conocimiento acerca de nuestros orígenes y de nuestra diversidad biológica y cultural".